BLASTデータベースが復旧しました BLASTデータベースが復旧し、再びご利用いただけるようになりました。 現在、Plant GARDENで公開されている607生物種に由来する804ゲノムに対応す...
Blast結果インターフェース(ベータ版)リリースのお知らせ Blast検索の結果に、GUI:グラフィカルユーザーインターフェースでアクセス頂けるようになりました。 検索結果のリンクから、登録遺伝子や遺伝子配列のページにア...
複数種について遺伝子機能情報を収集したGene Curation DSのリンクをPlant GARDENトップページに張りました。 複数種のそれぞれについて、文献から抽出した遺伝子機能情報、プライマー情報、ストレス耐性候補遺伝子、特許関連遺伝子、既知配列(UniProtKB、Araport)...
RNA-Seq Workflow (hisat2)を解析ツール一覧ページから公開しました。 シークエンスリードデータのクオリティ評価、トリミング、参照ゲノムへのマッピング、遺伝子/転写産物単位でのマップされたリード量を計測することで遺伝子発現量の推定を...
merge-gvcfを解析ツール一覧ページから公開しました。 複数のvcf(variant call format)またはgVCF(genomic VCF)ファイルを1つに統合できるツールです。Plant GARDENから...