Hayai-Annotation Plantsに関するBioinformatics誌の論文は、精度評価の手法が不十分であるとの意見が寄せられ、我々はこのことに対して真摯に対応し、the area under precision-recall curve (AUC-PR)を用いた再評価の結果を提出したにもかかわらず、再評価結果の内容について具体的な指摘を得ることなく、Bioinformatics誌からの一方的な通告により論文が取り下げられました。
https://academic.oup.com/bioinformatics/article/35/21/4427/5489908
そこでBioinfromatics誌に提出したAUC-PRを用いた精度評価に加え、the critical assessment of
functional annotation (CAFA)を指標にした評価も実施してその結果をBiorxivより公開しました。
https://biorxiv.org/cgi/content/short/2023.09.08.556781v1
これらの結果において、Hayai-Annotaion Plantsは高い精度を有していることが証明されました。Plant GARDENでは今後もHayai-Annotationによる機能アノテーションの結果を公開してまいります。